Wielkość zasobu archiwalnego Studium Polski Podziemnej szacuje się na około 250 metrów bieżących akt. W zasadzie wszystkie dokumenty, materiał ikonograficzny i multimedia są bardzo dobrze zachowane. Wyjątek stanowi niewielki zespół negatywów Wydziału Krajowego Ministerstwa Spraw Wewnętrznych, nad którego konserwacją trwają prace.
Trzonem zasobu archiwalnego SPP są dokumenty:
- Oddziału VI Sztabu Naczelnego Wodza w Londynie (odpowiedzialnego podczas II wojny światowej za łączność z okupowanym Krajem)
- Działu Społecznego Ministerstwa Spraw Wewnętrznych Rządu Polskiego na Uchodźstwie
W zbiorach archiwum SPP znajdują się także:
- Akta Komisji Weryfikacyjnych AK działających w latach 1945-1992 (teczki personalne ok. 40000 osób)
- Różnego rodzaju relacje i opracowania literackie żołnierzy Armii Krajowej
- Kolekcje dokumentów osób prywatnych oraz instytucji, których działalność związana była z Armią Krajową
- Broszury, afisze i prasa konspiracyjna
- Mapy i plany miast i regionów Polski
Ponadto Studium dysponuje:
- Bogatą kolekcją fotografii, przeźroczy, negatywów, filmów i mikrofilmów
- Fonoteką i video-teką
- Zbiorem muzealiów